Attore originario del Canada, dove è nato e cresciuto. Nel 1956 si trasferisce a New York per tentare la carriera di attore.
Appare in numerose produzioni televisive (tipo Alfred Hitchcock Presenta, Ai confini della realtà e Il Dottor Kildare), ma la vera svolta è nel 1966 quando viene scelto dal produttore Gene Roddenberry per interpretare il ruolo del Capitano Kirk in Star Trek. La serie termina nel 1969, ma tale è il successo che nel corso degli anni sono prodotti un cartone animato, varie pellicole cinematografiche (tra cui quella del 2009 a opera di J.J.Abrams) e dei videogame. Sia come attore che come doppiatore, Shatner viene sempre riconfermato per interpretare il suo ruolo ad oggi più famoso.
Oltre a Kirk, dal 1982 al 1986, indossa pure i panni del Sergente T.J. Hooker nell'omonimo programma televisivo poliziesco.
Shatner lavora soprattutto per il piccolo schermo, al cinema lo si vede saltuariamente: nella commedia Palle in canna (1993), in Miss Detective (2000) e in Dodgeball - Palle al balzo (2004). Nel 2007 gira la miniserie Everest e nel 2009 Fanboys, commedia su un gruppo di amici che tenta di vedere in anteprima il capitolo Star Wars Episodio I - La minaccia fantasma poichè uno di loro è malato terminale di cancro.
Nel 1989 si è cimentato persino nella regia e ha diretto il film Star Trek V: L'ultima frontiera. A partire dal 1995 ha pubblicato anche una saga da lui scritta, dal titolo I figli del paradiso, ambientata nell'universo di Star Trek.
Nel 2005 ha vinto il suo primo Golden Globe, come Miglior Attore Non Protagonista, per la serie TV Boston Legal, cui ha partecipato per 101 episodi nei panni dell'avvocato senza scrupoli Denny Crane.Si e' sposato quattro volte e ha avuto tre figlie con la prima moglie. Vive nel Sud della California e possiede anche una fattoria nel Kentucky. Ha due dobermann e come hobby ama cavalcare e giocare a tennis.